Gray Matter - приключенческая игра, в которой рассказывается о нейробиологе, докторе Дэвиде Стайлосе, потерявшем жену в ужасной аварии несколько лет назад. После случившейся трагедии он стал вести уединенный образ жизни, проводя свои дни в английском имении Dread Hill House. Однажды на его пороге появилась студентка из Америки, Саманта Эверетт (Samantha Everett), которая стала его помощницей.

Затем, после начала медицинских экспериментов, начинают происходить необъяснимые события. После их проведения в особняке стал являться призрак погибшей жены доктора. Дэвида и его помощницу Саманту охватывает огромное стремление раскрыть тайны эксперимента и выяснить всю суть происходящего.