Код Лиоко имеет матрицу типа помещения,научно-фантастического.Группа школьников посещают школу-интернат во Франции они наткнулись на заброшенную фабрику недалеко от школы. Внутри завода, мощный суперкомпьютер лениво ждет, держа Зену в виртуальном мире в свою очередь люди страдают от живых вирусов: Зены.Друзья скором времени начинают путешествие в этот мир, называемый Лиоко, надеясь спасти его от порабощения вирусом Зена ,школьники должны принимать вызовы Зены и спасти весь мир.

Игра создана по аниме сериалу Code Lyoko, в которой вы увидите четырёх студентов обладающих двумя параллельными жизнями. В реале они студенты но вот по другую сторону реальности они отважные герои которые сражаются с разнообразной нечистью в различных местах вселенной. Только там… в потусторонности они могут показать все свои невероятные способности.