Действие игры происходят в конце 19 века в викторианской Англии (Лондон).
Главной героиней является девочка - Ханна/Hanna/ハンナ, потерявшая в детстве родителей и которую растил дед, он был кукольным мастером.
Ханна/Hanna/ハンナ унаследовала способность своего дедушки делать "элементных кукол” , но тот запретил ей делать их после того, как она сделала свою первую куклу, ее горничную Эмили. После смерти дедушки, Ханна обнаруживает странную мужскую "элементную куклу” - Вилла, в подвале дедушкиной мастерской. Кто создал Вилла и для чего? Почему он зовет ее "хозяйкой"? Все это лишь малая часть тех тайн и загадок, которые Хане предстоит раскрыть...