Mortal Kombat Trilogy можно назвать заключением эпохи 2D для серии, эдаким подведением итогов. Фактически, единственной целью данного проекта было свести всех бойцов из первых трех частей на одну арену, дабы прекратить споры, вроде Joni Cage порвал бы Nightwolfа, если бы им было суждено встретиться на ринге. Теперь могут и встретиться, определив на практике, кто круче. Некоторое удивление как у игроков, так и у самих дерущихся, могут вызвать двойники, встречавшиеся в разных исполнениях. Например, Sub-Zero может бросить вызов его клон - Sub-Zero, который появился в третьей части и был уже без синей маски!