Обряд инициации - самое важное испытание в жизни каждого мальчика. Его можно либо выдержать с честью и стать мужчиной, либо не выдержать вообще и никогда не вернуться из кишащего чудовищами леса. Молодой шестнадцатилетний герой Final Fantasy Crystal Chronicles: Echoes of Time с честью преодолел все преграды и возвратился в родную деревню с победой.

Однако радость, как это часто бывает, оказалась недолгой. Торжества в честь триумфального возвращения юного воина омрачились страшным несчастьем. Одна из деревенских девушек почувствовала себя плохо, и вскоре выяснилось, что она страдает так называемой "кристаллической болезнью" - недугом редким и плохо поддающимся лечению. Чтобы спасти несчастную, юноша покидает родное поселение и отправляется в огромный негостеприимный мир. Но вскоре он узнает, что кристаллы - это всего лишь артефакты прошлого, не сохранившиеся до наших дней. Неужели шансов на спасение от болезни нет? Выяснить это предстоит вам!